Bifidobakterien sind für den Menschen nicht nur unbedenklich, sondern sogar lebensnotwendig. Sie wandeln zahlreiche schwer oder gar nicht verdauliche Bestandteile unserer Nahrung (z.B. Inulin) in für uns wichtige und wertvolle Nährstoffe um.

Zur normalen Bakteriengesellschaft von Magen-Darm-Trakt, Appendix (Blinddarm) und Vagina gehören u. a. Bifidobacterium bifidum, B. adolescentis, B. breve, B. longum und B. infantis.

Bestimmte Bifidobakterien werden auch zur Herstellung von Milchprodukten durch Fermentierung verwendet, etwa für Käse und Bifidusmilch, eine Form der Dickmilch.